一、野生植物
　　阿拉善盟种子植物约有72科、322属、612种。除大多数是牲畜牧草外，尚有许多具有经济价值和药用价值的植物。
　　贺兰山次生林区有乔灌木、藤木、草本植物496种，可作中草药材100多种，其中重要的有贺兰山黄芪、贺兰山丁香、瞿麦、土三七、叉子圆柏、高山地榆、郁李仁、沙冬青、远志、酸枣、达乌里龙胆、柴胡、益母草、薄荷、天仙子、枸杞、地黄、车前子、茜草、中蒡、蒲公英、藜芦、黄精、玉竹、小红菊等。菌类植物也较多，以紫蘑菇、龙须蘑菇为主。植物有中国及内蒙古自治区独有的稀贵特有种植物17种，是内蒙古自治区特有植物分布中心，是植物资源宝库。
　　全盟属亚洲荒漠植物区，牧草以菊科、蒺藜科、藜科、柽柳科、蔷薇科和部分禾本科、豆科种类成份最多。荒漠次生林区主要指阿拉善盟额济纳旗的胡杨林、沙枣林和梭梭林区。梭梭灌木林约810万亩，寄生在梭梭根上的肉苁蓉素有"沙漠人参"之称；白刺灌木约90万亩，寄生在白刺根上的"锁阳"，有补阳、润肠、通便功能。还有甘草60万亩，年产鲜甘草70万公斤，苦豆子150万亩。骆驼喜食的饲草有梭梭、柽柳、沙拐枣、花棒、红砂等。胡杨及其林下的芦苇、芨芨草、马莲、沙莲等10多种经济价值较高的野生植物。人能食用的有沙竹、沙米、沙枣、沙菊、沙芥。湖盆边缘的绢毛萎陵菜，根内贮有大量淀粉。
　　在森林和草原还盛产蘑菇、发菜等，蘑菇品种达十几种，其中以贺兰山紫蘑质量最好，味浓而闻名区内外。阿拉善盟盛产发菜，是一种珍兰藻类植物，色黑，干时形似乱发，故又名"头发菜"，它是一种珍贵菜肴，畅销国内外市场。

　　二、野生动物
　　阿拉善盟地域辽阔，有森林、草原湖泊、沙漠戈壁、山地、丘陵等不同的生态环境，是野生动物得天独厚的繁衍地，生长着约200余个种类，受国家一、二、三类保护的有27种。
　　贺兰山的深山密林中有森林动物36科110余种，金钱豹、马鹿、獐(麝)、胡兀鹫、狐狸、扫雪、猞猁、青羊、红羊、盘羊等。金钱豹属国家一类保护动物，鹿獐(麝)是非常贵重的药用动物。猞猁是珍贵的毛皮兽。兰马鸡是中国特产，生长在贺兰山区，一种美丽的观赏鸟，由于它那美味的肉和珍贵的尾羽招致过度捕杀，数量日减，属国家三类保护鸟，必须加强保护。在贺兰山还栖息着数量可观的各种珍贵鸟类。
　　荒漠草原上生存着野骡子、黄羊、赤狐、獾、狼、草兔、毛腿沙鸡、黄鼠、长爪沙鼠、跳鼠、沙蜥、沙蟒、鹰等。蒙古野驴和野骆驼是世界上最珍贵的兽类，也是内蒙古自治区列入国家保护的一类动物。
　　在湖泊里有大头鱼、鲫鱼、鲤鱼、草鱼、链鱼和少量的武昌鱼、团鱼等鱼类，野鸭、黄鸭、麻鸭、白额大雁、天鹅、白天鹅、水獭等。受国家二类保护鸟一天鹅，其肉味美，绒可作高级防寒被服材料。现数量少，严加保护。水獭是国家二类保护的兽类，是珍贵的毛皮兽。
　　复杂多样的地理条件为动物提供了多种多样的栖息环境。阿拉善盟动物资源丰富，其中1／3以上有重要的经济和科学价值，如果能加以科学地利用和保护，是一项取之不尽、用之不竭的资源。近20多年由于多种原因，特别是栖息地的改变和乱杀滥捕，野生动物数量急剧下降，一些珍稀动物趋于濒临灭绝的境地。应采取措施加强保护。

　　阿拉善盟生态动物群属于温带荒漠、半荒漠动物群，群落结构简单，种类贫乏。据不完全统计，全盟共有两栖类、爬行类、鸟类、兽类野生动物188种。
　　两栖类和爬行类  两栖类有3种：黑斑蛙、中国林蛙、华北蟾蜍。
　　爬行类有9种：河套蜥蜴、丽斑麻蜴、密点麻蜴、荒漠马蜥、麻锦蛇、蝮蛇、白条锦蛇。
　　鸟类　　据不完全统计，全盟共有鸟类150多种约80％为候鸟，属国家保护的鸟7种。贺兰山鸟类资源丰富，据调查，共录得鸟类115种，另5亚种分属于10目30科，最大的科是鸫科17种，其次是鹰科14种、雀科13种。在120种和亚种鸟类中繁殖鸟85种(留鸟和夏候鸟)，以贺兰山命名的鸟类就有两种：贺兰山红尾鸲、贺兰山岩鹨。国家一级保护鸟类有金雕、白尾海雕。国家二级保护鸟类：苍鹰、雀鹰、松雀鹰、秃鹫、猎隼、红隼、游隼、红脚隼、兰马鸡、长耳鸮、雕鸮、红角鸮、草鸮、纵纹腹小鸮等。提供皮羽产品的鸟类有白尾海鹃、金鹃、草原鵰、胡兀鹫、雀鹰、蓓鹭等12种；提供肉食鸟类有红雁、互雁、野鸭、白骨顶、毛腿沙鸡、石鸡、岩鸽等18种；观赏鸟类有天鹅、黑鹳、兰马鸡、雪鸡、灰鹤、蓑羽鹤、白鹭等9种。
　　经济兽类　　经济兽类全盟有27种。用于皮毛的有狐狸、狗獾、艾虎、黄鼠、黄鼬、猪獾、旱獭、石貂等；皮肉兼用的黄羊、盘羊、岩羊、北山羊、蒙古兔、野猪等6种；观赏动物有野驴、野骆驼2种；药用兽类有马鹿、麝、雪豹、刺猬等4种。
　　国家保护的野生动物　　阿拉善盟188种野生动物中，属国家保护的有27种；一级保护动物6种，二级保护动物10种，三级保护动物11种。